Post mortem – 1. hét

A reggeli csoportnak még egyszer köszönöm a megértését a bigyo halálközeli állapotba hajszolása miatt, tényleg úgy látszik, hogy a kurzus a létező számítógépes rendszerünk korlátait feszegeti, úgyhogy a jövőben ezt is jobban figyelembe veszem. Ahogy mondtam, a beadandók között nem kell az EMBOSS-t telepíteni, elég a GenBank flatfile-ket boncolgatni. Aki kodon gyakoriságot szeretne nézni, az a cusp programot futtassa:megtalálható a ~genome/packages könyvtár alatt a …EMBOSS-6.5.7/emboss/cusp elérési útvonalon. (Argumentumok nélkül futtatható, megkérdezi majd, hogy milyen fájlon akarod futtatni — add meg, hogy AT6.gbk vagy Chry5.gbk — és hogy hova írja az eredményt — amit szeretnél).

Azt is beállítottam végre, hogy működjenek a blogon a hozzászólások, úgyhogy nyugodtan írjatok ide mindenről (pl. kérdések, tanácsok panaszok, vagy akár párkeresés).

Ha magadnak le szeretnéd tölteni a genom fájlokat, azt ezeken a linkeken teheted meg:

  • Chry5 (reggeli csoport): http://bit.ly/1QmwRw0
  • AT6 (esti csoport): http://bit.ly/1Tol4MD

2. szekció + kurzus eleji felmérés

Egy nap alatt betelt a kurzus, úgyhogy indítani kellett egy 2. szekciót is, szerda esténként 17–20 órakor. Arra kérnék mindenkit, hogy

  • [kötelezően] iratkozzon fel erre a blogra akármilyen e-maillel ami neki jó: mindent ide fogok feltölteni, nekem egyszerűbb, mint a CooSpace-n öt külön csoportba írni, és nem is jelszó-védett; és
  • [önkéntes alapon] találja ki a kurzusra a geek kódját egy rövid táblázatot kitöltve a háttérismereteiről: https://www.surveymonkey.com/r/86TDC32 Ez 7 kérdés, mindegyikre 0-4 skálán kell válaszolni, pikk-pakk meg lehet csinálni. Egyrészt az eredmények alapján jobban tudok készülni, másrészt érdekes lesz majd összeveteni egy szemesztervégi felméréssel.